Kiertokapulan hallinnosta ja toiminnan asianmukaisesta järjestämisestä huolehtii hallitus, johon kuuluu kolmetoista varsinaista jäsentä, joilla kullakin on henkilökohtainen varajäsen.
Omistajakunnista muodostuva nimitysvaliokunta tekee hallituksen jäsenistä esityksen yhtiökokoukselle. Yhtiökokous hyväksyy esitykset ja nimittää hallituksen puheenjohtajan ja varapuheenjohtajan. Hallituksen puheenjohtaja valitaan alueelta, jolla sijaitsee Kiertokapulan jätteidenkäsittelylaitos, jätteen loppusijoituspaikka tai sellainen käytöstä poistettu jätteen loppusijoituspaikka, jonka osalta yhtiötä koskevat edelleen ympäristölupien seurantavelvoitteet.
Hallituksen kauden pituus on yhtiöjärjestyksen mukaisesti kaksi vuotta.
Hallituksen jäsenet 11.5.2023 alkaen
puheenjohtaja Johanna Sipola, Hämeenlinna
varapuheenjohtaja Jari Vainio, Nurmijärvi
Satu Salmela-Vierisalo, Kerava
Petteri Pullola, Hattula
Mikko Sallinen, Hausjärvi
Riika Raunisalo, Hyvinkää
Mira Ahjoniemi, Riihimäki
Pirjo Alijärvi, Janakkala
Ismo Nöjd, Järvenpää
Ossi Kollin, Loppi
Annika Warras-Stjernvall, Mäntsälä
Kalle Ikkelä, Tuusula
Jukka Käkönen, Valkeakoski
Kiertokapulan osakaskunnat sitoutuivat keväällä 2018 pidetyssä yhtiökokouksessa hallintoneuvoston lakkauttamiseen.
Vuonna 2019 jokainen osakaskunta sai hallituspaikan, kun hallintoneuvosto lakkautettiin.
